Vide ir galvenais mikrobioloģiskā piesārņojuma avots pārtikas rūpniecībā. Tajā pašā laikā lopkopībā vide var norādīt, vai saimniecības drošības programma darbojas pareizi. Tādējādi vides testēšana ir kļuvusi par svarīgu jebkuras pārtikas un barības nekaitīguma programmas sastāvdaļu.